Podle ochránců přírody by byl průplav Dunaj – Odra ekologickou katastrofou [rešerše | kategorie: Vodní doprava – ČR | Moravskoslezský den | Boleslav Navrátil | 11. 6. 2001] [tisk] Rozhovor s pracovníkem ČSOP Milanem Orálkem, s vedoucí CHKO Poodří Vladimírou Hamplovou a s Jiřím Lehkým z CHKO Litovelské Pomoraví. Podle nich by došlo k rozsáhlé likvidaci lužních lesů, charakter krajiny by se prohloubením a napřímením toků podstatně změnil. Šlo by také o likvidaci přirozených meandrujících toků a přirozených stanovišť živočichů, ovlivnění klimatu v oblasti apod. Kromě toho CHKO Poodří je zařazeno do evropské Úmluvy o mokřadech. Kanál by také vyvolal nárůst průmyslových, obchodních a dopravních aktivit. Vliv trasy kanálu (z let 1972 a 1989) na přírodu posuzovala Ekologická sekce Čs. biologické společnosti. Na základě výsledků pak ministr životního prostředí Bedřich Moldan v roce 1990 další přípravy stavby kanálu nedoporučil.